مطالعه خصوصیات فنوتیپی و ژنوتیپی باکتری های متعلق به خانواده enterobacteriaceae عامل پوسیدگی نرم سیب زمینی در استان کرمانشاه

سیب زمینی از محصولات مهم زراعی در استان کرمانشاه به شمار می آید. طی سالیان اخیر پوسیدگی نرم غده و ساقه، تولید این محصول را در منطقه با تهدید جدی روبرو کرده است. هدف از این پژوهش جداسازی و شناسایی باکتری های مرتبط با این بیماری بود. بدین منظور در پاییز 1392 و بهار 1393 طی چند نوبت از مزارع آلوده در سطح استان بازدید و از غده های آلوده به همراه خاک اطراف آنها نمونه برداری گردید. پس از انتقال نمونه ها به آزمایشگاه گروه گیاه پزشکی دانشگاه رازی، جداسازی باکتری ها به روش معمول خیساندن قطعات خرد شده هر نمونه در آب و کشت سوسپانسیون حاصل روی محیط های کشت آگار غذایی انجام شد. بر اساس خصوصیات مرفولوژیکی کلنی های رشد یافته و نتایج آزمون های فیزیولوژیکی و بیوشیمیایی، باکتری های جدا شده به باکتری های جنس pectobacterium spp. شباهت داشتند. اما این خصوصیات با خصوصیات ذکر شده برای گونه های شناخته شده این جنس، صد در صد مطابقت نداشت. بیماری زایی جدایه ها در دو سری آزمون لهانیدن ورقه های سیب زمینی و هویج در تشتک پتری و تزریق سوسپانسیون باکتری به غده سیب زمینی کاشته شده در گلدان و بررسی پیشرفت بیماری در گیاهچه¬های رشد یافته بررسی گردید و از گیاهان دارای علائم، باکتری مورد نظر مجدداً جداسازی شد. آزمون pcr با جفت آغازگرهای اختصاصی y1/y2, expccf/expccr برای باکتری های متعلق به جنس pectobacterium انجام شد که قادر به شناسایی هیچ یک از جدایه های سیب زمینی غیر از جدایه استاندارد pectobacterium carotovorum subsp carotovorum نبود. اما pcr با جفت آغازگر s1f/s1r برای جدایه های pectobacterium شایع در منطقه باندهای اختصاصی 300 و 400 جفت بازی را در همه جدایه های سیب مینی تکثیر نمود. تنوع ژنتیکی میان جدایه ها با استفاده از روش rep- pcr و با آغازگر eric و box بررسی شد که بیانگر تنوع زیادی بین جدایه¬های مورد بررسی بود.